首期节目中，吴尊、王中磊、贾乃亮和李小鹏四个爸爸在和孩子们相处的过程，囧态不断，很多网友评价“笑得根本停不下来”。但是尽管爸爸们不擅照料，手忙假乱，但“拼尽全力”希望能够把孩子照顾好，以及一些微小细节反映出来的“浓浓父爱”仍让观众们感受到了“父亲默默的爱”。
不过节目在首播后也引起了不少争议。不少网友吐槽：爸爸帮孩子洗澡的时候镜头会不会曝光得太多了？这档节目会不会和《爸爸去哪儿》太相似了？贾乃亮会不会太演了？剪辑太平了？节目组对此作了第一时间回应。
浙江卫视宣传统筹王征宇表示，《爸爸回来了》这档节目，是建立在对所有的家庭真实记录的基础上的。这个节目之所以能够打动这些嘉宾来参加，1、节目不需要嘉宾配合档期，而是节目组配合嘉宾档期；2、唯一的拍摄准则就是“妈妈不在家”，我们不对爸爸们要做什么，想做什么做任何设计。所以爸爸们在节目中所做的都源于他们真实的状态，其实从一定程度上也反映了这四个家庭和爸爸的特性：1、贾乃亮，80后新晋父亲，自己还是个大孩子，拼命想照顾孩子证明自己却有心无力；2、王中磊，忙于工作的传统父亲，爱孩子却口难开；3、李小鹏，中西合璧的家庭，有自己独特的教育方法；4、吴尊，“好奶爸”，擅于学习各种教育方法并为我所用。
节目组在节目播出当晚，也在微博上做了一个意见搜集和整理贴，希望所有的网友都能够来提意见和建议，确实有不少网友表示是否孩子们洗澡曝光过度，在听到这种声音后，导演组也充分听取意见，在后面几天的重播中对镜头重新做了剪辑处理，适当规避。在接下来的拍摄中，也会注意到这方面的情况，请大家放心。
导演组表示，在节目拍摄完成之后，贾乃亮对导演说的第一句话是：不会吧，我实在太不合格了，这样放小璐会骂我的。确实，在拍摄中，贾乃亮真的非常想证明自己“是一个称职的父亲”，但实在“业务水平有限”，为什么要给孩子做饺子，“因为小璐不太想让孩子出去吃，然后我也真的特别想做一顿饺子证明自己可以做饭”，亮亮表示，小甜心是自己的命根子，他已经意识到自己的不足，接下来一定要让大家看到自己业务水平的提高和成长，交出一份满意的答卷。
节目组表示，因为真实记录，所以有的部分会剪辑上会让大家觉得“略显平淡”，但如果可以去设计爸爸和孩子的任务或游戏，就会让“真实记录”变味，反映不出每个家庭的真实状态。正因为全程真实记录，才让大家看到不同社会家庭的现状和不同爸爸类型的缩影。节目组以前不会今后也不会对内容做任何设计，第一期平行剪辑让大家明了，每个家庭分别是什么样，接下来，家庭们的串门等都会出现，我们希望通过12期节目，让大家能看到爸爸们的成长和蜕变。为什么要叫《爸爸回来了》这个名字，确实目前在中国的社会家庭形态下，“爸爸”的角色一定程度上是缺位的，我们期待这些“男孩式的爸爸”“爱在心底口难开忙碌式”的爸爸，能够在节目的录制过程中，逐渐成长，真正做到在家庭生活中“爸爸回来了”。
